《第三军医大学学报》是经中国人民解放军总政治部、国家科技部及国家新闻出版署批准，由第三军医大学主管、主办，国内外公开发行的综合性医药卫生类学术刊物。

《第三军医大学学报》是中国被引频次最高的500种科技期刊之一。自1989年以来，《第三军医大学学报》先后20余次获全国、全军、教育部和省、市优秀科技期刊一、二等奖，2003年、2005年两度被评为“国家期刊奖百种重点科技期刊奖”（该奖项为中宣部、国家新闻出版总署和国家科技部共同评选的我国期刊界的最高奖项）。2008、2009、2010、2011连续4年入选“百种中国杰出学术期刊”，2008、2010连续2届被教育部科学技术司评为“中国精品科技期刊”和“中国高校精品科技期刊”。